• 2008-08-06

    锋电位分析工具SPKtool - [工作]

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    http://liuxqsmile.blogbus.com/logs/27242976.html

          SPKtool是一个在MATLAB平台上编写的神经元锋电位分析工具软件,具有锋电位检测、聚类以及放电序列统计分析等功能,可以满足神经信号分析的大部分要求。并且带有批处理功能,可以加快大量数据的分析速度。SPKtool集成了锋电位分析中常用的成熟算法,并且代码是开放的,方便使用者进行二次开发,根据需要扩展其功能。软件具有直观的图形化界面和详细的说明文档,使用方便。 

    其功能包括

    锋电位检测:

    Ø       显示记录信号中锋电位峰值的分布曲线;

    Ø       通过阈值检测锋电位;

    Ø       通过原始信号、能量、非线性能量进行检测;

    Ø       三种锋电位波形对齐方式:阈值、波谷、波峰。

    Ø       GUI交互式界面。

    特征提取:

    Ø       多种常用特征:PCA,峰值、能量等;

    Ø       小波方法;

    Ø       特征分别图,特征密度分布图等。

    聚类分析:

    Ø       K-means

    Ø       模板匹配;

    Ø       基于高斯混合模型的EM算法;

    Ø       Valley seeking

    Ø       通过绘制轮廓线,手动聚类;

    Ø       对聚类结果进行合并,删除等。

    动作电位串分析:

    Ø       相邻动作电位间隔分布图(ISI)

    Ø       Poincare map

    Ø       相关函数图;

    Ø       锋电位分布光栅图;

    Ø       放电频次直方图;

    Ø       刺激前后放电直方图(PSTH);

    Ø       刺激前后放电光栅图。

    软件及使用手册下载地址: http://groups.google.com/group/liuxq-works/web

    界面截图:

     

      

      

     

     


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